گروه 1:
هپکو اراک 2-2 آریا سپاهان قم (26/10/1388)
گلچین رباط کریم 0-0 فولاد یزد (26/10/1388)
ذوب آهن اردبیل 0-3 سپیدرود رشت (26/10/1388)
ماشین سازی تبریز 5-0 پالایش گاز ایلام (26/10/1388)
(مقاومت تهران: استراحت)
گروه 2:
شهرداری لنگرود 0-0 نوژن مازندران (26/10/1388)
نفت و گاز گچساران 0-1 شهرداری یاسوج (26/10/1388)
پرسپولیس گناوه 2-1 پرسپولیس زاهدان (26/10/1388)
نفت اهواز 2-0 پرسپولیس بجنورد (26/10/1388)
(نیروی زمینی تهران: استراحت)
گروه 3:
گاز سرخس 0-0 سایپا شمال مازندران (26/10/1388)
داماش تهران 2-1 شهرداری ماهشهر (26/10/1388)
آرد گلستان ۴-۱ پرسپولیس برازجان (27/10/1388)
صنعت نفت نوین آبادان 1-0 استقلال قزوین (26/10/1388)
(هما تهران: استراحت)
گروه 4:
شهرداری انزلی 2-1 مقاومت مازندران (26/10/1388)
آرمین تهران 3-1 شهرداری زنجان (26/10/1388)
شهرداری همدان 5-2 خیبر بوژان لرستان (2۵/10/1388)
شهرداری شهرکرد 0-3 افتخار خراسان جنوبی (26/10/1388)
(استقلال جنوب تهران: استراحت)